Недавно начал использовать онлайн сервис хранения данных - DROPBOX.
Очень удобно, чтобы не таскать флешку из дома на работу и обратно для синхронизации файлов. Данные между клиентским ПК и сервисом передаются через SSL, однако само файловое хранилище не шифруется. Выход - использовать TrueCrypt.

Для этого нам нужно:
1) установить Dropbox;
2) установить TrueCrypt;
3) создать защищенный контейнер в каталоге "My Dropbox";
4) убрать галочку Truecrypt -> Settings -> Preferences -> Preserve modification timestamp of file containers (с этим пунктом осторожно, он повлияет и на поведение других контейнеров).

Dropbox синхронизирует изменившиеся блоки данных после размонтирования контейнера.